مرجع‌نگاري در پروپوزال تابع اصول كلي مرجع‌نگاري مي‌باشد كه در ساير متون علمي و پژوهشي همچون مقالات علمي و كتب بصورت رايج مورد استفاده است.
شايعترين روش در اين زمينه مبتني بر سبك ونكوور مي‌باشد كه مورد استفاده اكثريت مجلات معتبر پزشكي نيز قرار دارد.
عمده‌ترين منابع مورد استفاده در زمينه مرجع‌نگاري شامل مقاله، كتاب و منوگراف و منابع اينترنتي (آنلاين) مي‌باشد. جهت تنظيم فهرست مراجع به موارد ذيل توجه نماييد.
1- مقاله
Author. Title. Journal. Year (of Publication); Volume (Issue): Pag.
Rose ME, Huerbin MB, Melick J, Marion DW, Palmer AM, Schiding JK, et al. Regulation of interstitial excitatory amino acid concentrations after cortical contusion injury. Brain Res. 2002;935(1-2):40-6.
2- كتاب
Author. Title. Edition. Place: Publishier; Year: Page.
3- منابع اينترنتي (آنلاين)
در رفرانس‌نويسي منابع اينترنتي ضمن نگارش مشخصات منبع بصورت گذشته آدرس اينترنتي و زمان دسترسي به آن منبع نيز ذكر مي‌شود.
Available at: http://www.
Accessed: month day, year.
الف) كتاب داراي نويسنده:
Murray PR, Rosenthal KS, Kobayashi GS, Pfaller MA. Medical microbiology. 4th ed. St. Louis: Mosby; 2002.
ب) يك فصل از كتاب داراي نويسنده و ويراستار
Meltzer PS, Kallioniemi A, Trent JM. Chromosome alterations in human solid tumors. In: Vogelstein B, Kinzler KW, editors. The genetic basis of human cancer. New York: McGraw-Hill; 2002. p. 93-113.
ج) كتاب مقالات همايش
Harnden P, Joffe JK, Jones WG, editors. Germ cell tumours V. Proceedings of the 5th Germ Cell Tumour Conference; 2001 Sep 13-15; Leeds, UK. New York: Springer; 2002.
نحوه تنظيم مراجع در اين بخش براساس ترتيب استفاده از آنها در بخش «بررسي متون» از پروپوزال مي‌باشد. به اين صورت كه مرجع مورداستفاده در مرور بر متون با ذكر شماره از يك الي آخر (داخل پرانتز يا بالاي خط) صورت مي‌گيرد و هر جا مجدداً به آن مرجع ارجاع گردد، همان شماره اوليه قيد مي‌شود. سپس مراجع مورد استفاده به ترتيب استفاده در متن در بخش فهرست مراجع (References) تنظيم مي‌شوند. در صورتيكه در هر محل ديگري در پروپوزال ارجاع به يكي از مراجع ضرورت يابد مي‌توان آنرا با ذكر شماره آن مرجع مشخص كرد.